Kit qPCR per alimenti e ambiente
DNA Extraction Kit Rapid
Per l'estrazione del DNA di batteri e lieviti.
- Codice
- LC-6504
- Categoria
- Kit qPCR per alimenti e ambiente
- Formati
- 2 formati
- Conservazione
- da 2 a 25 °C
Il kit offre un modo semplice per preparare ed estrarre i campioni per l'analisi del DNA di batteri e lieviti. Per i microrganismi batterici si raccomanda un pre-arricchimento con il terreno di coltura adatto; il DNA batterico si può estrarre con il Lysis buffer, dopo un passaggio di concentrazione per centrifugazione, da campioni di alimenti, acqua, mangimi ecc., secondo i metodi standard (ISO 6579, ISO 11290, ISO 16654 e così via). Per i lieviti si raccomanda un passaggio aggiuntivo con l'enzima liticasi.
Caratteristiche principali
100-200 preparazioni (LC-6504) o 250-500 preparazioni (LC-6505).
Introduzione e descrizione del prodotto
La lisi avviene per shock termico e un passaggio di centrifugazione elimina parte dei residui cellulari. Il surnatante si può usare direttamente per le reazioni successive, come la rilevazione con real-time PCR, oppure dopo un passaggio di diluizione per eliminare gli inibitori residui della PCR.
Contenuto e conservazione
| Nome della provetta | Volume, 100-200 preparazioni (LC-6504) | Volume, 250-500 preparazioni (LC-6505) | Conservazione |
|---|---|---|---|
| Lysis buffer | 20 mL | 50 mL | TA |
Conservare a temperatura ambiente (TA).
Materiale necessario non fornito
- Provette per microcentrifuga (1,5-2,0 mL)
- Micropipette e puntali con filtro per micropipette (10-100 µL e 100-1000 µL)
- Vortex
- Microcentrifuga in grado di arrivare a 14.000 g
- Blocco riscaldante (preferibilmente) o bagnomaria a 95 ± 5 °C
- Guanti senza talco
Avvertenze e precauzioni
- Questi prodotti sono esclusivamente per uso in vitro, solo per uso di ricerca (RUO).
- Questi prodotti sono solo per uso nel settore alimentare.
- Il test richiede personale qualificato per evitare il rischio di risultati errati.
- Non mescolare reagenti di lotti diversi.
- Non usare reagenti di prodotti di altri produttori.
- Indossare guanti monouso e camici da laboratorio quando si manipolano campioni e reagenti.
- Usare puntali sterili con filtro.
- Evitare il contatto di campioni e reagenti con pelle, occhi e mucose. In caso di contatto con queste soluzioni, sciacquare subito con acqua e consultare immediatamente un medico.
- Le schede di dati di sicurezza (MSDS) sono disponibili su richiesta.
- I rifiuti vanno trattati e smaltiti nel rispetto delle norme di sicurezza applicabili.
- Pulire periodicamente il piano di lavoro con ipoclorito di sodio almeno al 5 %.
- Si raccomanda vivamente di avere aree, materiali e attrezzature dedicati per l'estrazione del DNA, la preparazione della PCR e le procedure post-PCR.
Informazioni sull'uso del kit
Prima dell'uso mescolare leggermente il contenuto del kit.
In condizioni ambientali fredde, in alcuni componenti del kit si può formare un precipitato. In questo caso scaldare il componente per circa 5 minuti a 37 °C per sciogliere il precipitato e agitarlo bene prima dell'uso.
Procedura
Procedura 1: isolamento del DNA batterico da coltura di pre-arricchimento o di arricchimento
Concentrazione del campione:
- Centrifugare 1 mL di terreno di pre-arricchimento o di arricchimento a > 10.000 g per 5 minuti. Eliminare il surnatante.
Evitare di trasferire residui di alimento dal terreno di arricchimento nella provetta per microcentrifuga.
FACOLTATIVO: prima del passo 2 eseguire un lavaggio: aggiungere 1 mL di PBS sterile, risospendere il pellet e centrifugare a > 10.000 g per 3 minuti. Eliminare il surnatante. Proseguire con il passo 2.
Lisi delle cellule:
- Pipettare 100-200 µL di Lysis buffer nella provetta per microcentrifuga e risospendere il pellet. Agitare vigorosamente su vortex.
- Centrifugare brevemente e incubare per 10-15 minuti a 95-100 °C.
- Centrifugare a > 10.000 g per 5 minuti.
- Trasferire il surnatante limpido in una nuova provetta per microcentrifuga.
- Usare subito il DNA o conservarlo a -20 °C se si vuole riutilizzarlo. Prima del riutilizzo omogeneizzare e centrifugare a > 10.000 g per 2 minuti.
Procedura 2: isolamento del DNA da prodotti lattiero-caseari
- Pipettare 100 µL di Lysis buffer nella provetta per microcentrifuga.
- Prelevare una piccola ansata di cellule da una piastra di coltura e sospendere le cellule nel Lysis buffer. Agitare vigorosamente su vortex.
- Centrifugare brevemente e incubare per 10-15 minuti a 95-100 °C.
- Centrifugare a > 10.000 g per 5 minuti.
- Trasferire il surnatante limpido in una nuova provetta per microcentrifuga.
- Usare subito il DNA o conservarlo a -20 °C se si vuole riutilizzarlo. Prima del riutilizzo omogeneizzare e centrifugare a > 10.000 g per 2 minuti.
Procedura 3: isolamento del DNA batterico da coltura di arricchimento
Concentrazione:
- Centrifugare fino a 50 mL alla velocità massima per 10 minuti. Decantare con attenzione il liquido, lasciandone circa 1 mL nel cono della provetta.
(Centrifugare volumi tra 1 mL e 50 mL.)
Lavaggio:
- Mescolare il liquido nel cono con un puntale, trasferirlo completamente in una microprovetta da 1,5 mL e centrifugare per 3 minuti a > 10.000 g.
- Con un puntale eliminare tutto il surnatante.
- Pipettare 700 µL di PBS sterile e risospendere il pellet con il vortex o pipettando su e giù. Centrifugare per 3 minuti a > 10.000 g.
- Con un puntale eliminare tutto il surnatante. Ripetere il passo 4 ancora una volta (tampone di lavaggio e centrifugazione).
- Con un puntale eliminare tutto il surnatante.
Lisi delle cellule:
- Pipettare 100 µL di Lysis buffer nella provetta per microcentrifuga e risospendere il pellet con il vortex o pipettando su e giù. (Se il pellet non è completamente coperto, aumentare il volume di Lysis buffer, non oltre 200 µL.)
- Aggiungere 3 µL di liticasi (15 U). (Aggiungere 3 µL di liticasi per ogni 100 µL di Lysis buffer aggiunti al passo 7.)
- Agitare su vortex e incubare per 15 minuti a 37 °C.
- Incubare per 10-15 minuti a 95-100 °C.
- Centrifugare a > 10.000 g per 5 minuti.
- Trasferire il surnatante limpido in una nuova provetta per microcentrifuga.
- Usare subito il DNA o conservarlo a -20 °C se si vuole riutilizzarlo. Prima del riutilizzo omogeneizzare e centrifugare a > 10.000 g per 2 minuti.
Flusso di lavoro
Procedura 1: coltura di arricchimento
- Concentrazione delle cellule: raccogliere 1 mL di terreno; > 10.000 x g, 5 min.
- Lisi delle cellule: 100-200 µL di Lysis buffer; 95/100 °C, 10-15 min; > 10.000 x g, 5 min; prelevare il surnatante.
Procedura 2: colonie isolate
- Lisi delle cellule: prelevare una piccola ansata di cellule; 100 µL di Lysis buffer; 95/100 °C, 10-15 min; > 10.000 x g, 5 min; prelevare il surnatante.
Procedura 3: DNA da bevande
- Omogeneizzazione delle cellule: raccogliere 1-50 mL; velocità massima, 10 min; decantare il surnatante.
- Lavaggio delle cellule: > 10.000 x g, 3 min; eliminare il surnatante; 700 µL di PBS; > 10.000 x g, 3 min; eliminare il surnatante; ripetere: 700 µL di PBS; > 10.000 x g, 3 min; eliminare il surnatante.
- Lisi delle cellule: 100-200 µL di Lysis buffer; 3-6 µL di liticasi; 37 °C, 15 min; 95-100 °C, 10-15 min; > 10.000 x g, 5 min; usare il DNA direttamente o diluito.
Risoluzione dei problemi
| Problema | Possibile causa | Soluzione suggerita |
|---|---|---|
| Bassa resa o bassa purezza del DNA | Condizioni di conservazione non appropriate | Il kit va conservato tra +15 e +25 °C. Il tappo del flacone va chiuso bene dopo ogni uso, per mantenere i valori di pH e la stabilità dei componenti del kit e per evitare contaminazioni. |
| Reagenti e campione non mescolati bene | Il campione va mescolato accuratamente dopo ogni aggiunta di reagente. | |
| Valore di assorbanza del DNA (A260) troppo alto | Concentrazione del DNA troppo alta o impurità nel DNA ottenuto | Il DNA ottenuto va diluito con acqua di grado biologia molecolare (per esempio 2 o 10 volte ecc.) prima della PCR. |
| Nessuna amplificazione dopo la corsa di PCR/qPCR | Presenza nel DNA ottenuto di impurità che inibiscono la reazione | Quando si trasferisce il DNA dopo la centrifugazione, fare attenzione a prelevare il DNA dalla parte superiore del liquido. Il DNA ottenuto va diluito con acqua di grado biologia molecolare (per esempio 2 o 10 volte ecc.) prima della PCR. |
Controllo qualità
Ogni lotto del kit è provato rispetto a specifiche predeterminate, per garantire una qualità costante del prodotto.
Limitazioni d'uso
Il kit deve essere usato solo secondo le relative istruzioni per l'uso.
I componenti del kit sono destinati esclusivamente all'uso in vitro e solo a scopo di ricerca. I prodotti sono destinati solo all'uso generale di laboratorio.
Le procedure di biologia molecolare, come l'estrazione del DNA e l'amplificazione per PCR, richiedono personale qualificato per evitare il rischio di risultati errati. Si raccomanda vivamente di avere aree, materiali e attrezzature dedicati per l'estrazione del DNA, la preparazione della PCR e le procedure post-PCR. Il flusso di lavoro in laboratorio deve procedere in una sola direzione, dall'area di estrazione all'area di amplificazione e rilevazione. Non riportare campioni, attrezzature e reagenti nell'area in cui si è eseguito il passo precedente. L'utente deve sempre leggere tutte le istruzioni fornite con il prodotto prima di eseguire il saggio. Non mescolare reagenti di lotti diversi. Non usare reagenti di prodotti di altri produttori. Indossare guanti monouso e camici da laboratorio quando si manipolano campioni e reagenti. Usare puntali sterili con filtro. I rifiuti vanno trattati e smaltiti nel rispetto delle norme di sicurezza applicabili.
Cosa ricevi
Spedito a temperatura controllata quando il prodotto lo richiede.
Ogni lotto è accompagnato dal suo certificato.
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